|
" بررسی تنوع مولکولی در توده محلی برنج رقم هاشمی از طريق نشانگرهای ريز ماهواره "
| شماره شناسایی
|
:
|
18859669
|
| شماره مدرک
|
:
|
۵۷۰۹۰
|
| نام عام مواد
|
:
|
[گزارش نهایی -ویژه]
|
| شناسه افزوده
|
:
|
ترنگ، علیرضا
|
|
|
:
|
ستاری، مجید
|
|
|
:
|
حسینی‌چالشتری، مریم
|
|
|
:
|
رودپیمای رشت‌آبادی، محمد
|
|
|
:
|
رمضانی‌شهرستانی، صدیقه
|
| عنوان اصلي
|
:
|
بررسی تنوع مولکولی در توده محلی برنج رقم هاشمی از طريق نشانگرهای ريز ماهواره
|
| عنوان اصلي به زبان ديگر
|
:
|
:Evaluation of molecular diversity of the rice landraces of Hashemi using microsatellite markers
|
| صفحه شمار
|
:
|
۹۳ ص.:مصور، عکس(رنگی)، جدول، نمودار
|
| وضعیت انتشار
|
:
|
رشت: موسسه تحقیقات برنج کشور، ۱۳۹۸
|
| فروست
|
:
|
شماره ثبت ۵۷۰۹۰ مورخ ۱۳۹۸/۱۲/۰۴
|
|
|
:
|
شماره طرح ۹۶۰۳۸۷-۰۱۷-۰۴-۰۴-۰
|
|
|
:
|
شماره نامه: سامانه سمپات
|
|
|
:
|
این طرح: مقدماتی است
|
|
|
:
|
۵۷۰۹۰
|
| خلاصه یا چکیده
|
:
|
برنج پس از گندم مهمترین محصول غذایی ایران میباشد. برنج هاشمی در حال حاضر در شمال کشور بیشترین میزان سطح زیر کشت را در بین ارقام برنج ایرانی دارد و از لحاظ کیفیت پخت و مشتری پسندی دارای جایگاه مناسبی میباشد. در این مطالعه به‌منظور سنجش میزان تنوع ژنتیکی موجود در 20 توده محلی برنج هاشمی به‌همراه ارقام شاهد گوهر و هاشمی (معرفی شده توسط موسسه تحقيقات برنج کشور) از 21 نشانگر ریزماهواره، صفات مورفولوژیک و کیفیت دانه استفاده شد. نتایج نشان داد که تمامی صفات عملکرد و اجزای عملکرد، صفات زراعی وخصوصیات فیزیکوشیمیایی دانه دارای اختلاف معنی‌داری در سطح یک درصد در میان توده‌ها بودند. تجزیه خوشه‌ای با کمک نرم‌افزارR ، ژنوتیپهای مورد مطالعه را به 4 گروه تقسیم کرد. گروه اول و سوم بیشترین فاصله را از هم داشتند. بر اساس اطلاعات حاصل از21 نشانگر مورد بررسی مشاهده گردید که در مجموع 96 آلل چند شکل با میانگین ۴/۵۷ آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شد. کمترین تعداد مربوط به نشانگر RM249 با 3 آلل و بیشترین آن به‌ترتیب مربوط به نشانگرهای RM19 و RM1109 با 6 آلل بود. میانگین تعداد آلل موثر ۳/۹۷ بود که RM249 با داشتن مقدار ۲/۲۵ کمترین و نشانگرهای RM413 و RM1109 با داشتن مقادیر ۵/۶۵ و ۵/۲۱ بیشترین مقادیر را دارا بودند. میزان تنوع ژنی و میزان محتوای اطلاعات چند شکل نشان داد که نشانگرهای RM234 و RM474 بيشترین و نشانگر RM249 کمترین میزان را داشتند. دسته‌بندی ژنوتیپها بااستفاده ازتجزیه‌ی خوشه‌ای توسط نرم افزار R انجام گرفت و ژنوتیپها به 4 کلاستر تقسیم‌بندی شدند. نتایج نشان داد آنچه که به نام رقم هاشمی در مناطق مختلف استان گيلان کشت میشود، در حقیقت یک توده بسیار متنوع است که در اثر استفاده از بذرهای خود مصرفی و احتمالاً اختلاط فیزیکی بذر ارقام مختلف، نوترکیبی بین آنها و يا موتاسيون، به یک توده بسیار متنوع تبدیل شده است. بنابراین، پیشنهاد میشود ضمن حفظ این ژنوتیپها در بانک ژن برنج و احتمالاً استفاده از خصوصیات مطلوب آنها در برنامه‌های به‌نژادی آینده، لازم است خالص‌سازی این توده متنوع نیز انجام شود و بذر خالص بهترین ژنوتیپها در اختیار کشاورزان قرار گیرد.واژه‌هاي كليدي: برنج، تجزیه‌ی خوشه‌ای، تنوع، ریزماهواره.
|
|
|
:
|
Rice is the most important source of food for more than half of the world's population. Currently, Hashemi rice has the highest area under rice in north of Iran and is better than other varieties in terms of cooking quality and customer satisfaction. In this study, to evaluate genetic diversity of 20 Hashemi cultivars and two varieties as control (Hashemi and gowhar- introduced by the Rice Research Institute of Iran), 21 polymorphic markers, for morphological and grain quality traits were used. The results showed that all of studied traits had a significant difference at 1% level. The cluster analysis using R software divided the studied genotypes into four groups. The first and third groups were the most spaced apart. Based on information from 21 markers, a total of 96 polymorphic alleles (with an average of 4.49 alleles per pair of initiators) were amplified. The lowest number of alleles was observed in the RM249 marker with 3 alleles and the highest was observed in RM19 and RM1109 markers with 6 alleles. The average number of effective alleles was 3.97. The RM249 had the lowest value (2.25) and the RM413 and RM1109 markers had the highest values (5.5 and 5.9), respectively. The amount of genetic diversity and the Polimorphic Information Content (PIC) data showed that the RM234 and RM474 markers had the highest and the RM249 marker had the lowest value for these traits. The genotypes were grouped using cluster analysis and R software and genotypes were divided into 4 clusters. The results showed that what is called of Hashemi cultivar, In fact, is a very diverse population, due to the use of noncertified seeds probably physical mixing of seeds of different cultivars, recombination or mutation occurred. Therefore, there are a lot of genetic differences among them. While maintaining the rice gene bank genotypes, it is necessary to purify the best genotypes and perform a variety of pure seeds to farmers. Keywords: Cluster analysis, Diversity, Microsatellite, Rice.
|
| |