| شماره شناسایی
|
:
|
18875859
|
| شماره مدرک
|
:
|
۶۲۴۹۲
|
| نام عام مواد
|
:
|
[گزارش نهایی -تجاری]
|
| شناسه افزوده
|
:
|
نظري، فهيمه
|
|
|
:
|
جعفري، حسين
|
|
|
:
|
قاسمي، ابوالقاسم
|
| عنوان اصلي
|
:
|
تهيه کيت تشخيصي مبتني بر لمپ(LAMP) براي رديابي سريع عامل بيماري لکه نواري باکتريايي در بذور گندم
|
| نام نخستين پديدآور
|
:
|
نظري، فهيمه
|
| عنوان اصلي به زبان ديگر
|
:
|
Preparation of LAMP-based diagnostic kit for rapid detection of Bacterial Leaf Streak in wheat seeds
|
| وضعیت انتشار
|
:
|
تهران: موسسه تحقيقات گياه پزشكي كشور، ۱۴۰۱
|
| فروست
|
:
|
شماره ثبت ۶۲۴۹۲ مورخ ۱۴۰۱/۰۸/۲۲۶۲۴۹۲
|
|
|
:
|
شماره طرح : 2-16-16-087-990695
|
|
|
:
|
سامانه سمپات
|
| توصیفگر
|
:
|
بیماری باکتریایی نواری گندم
|
|
|
:
|
کیت
|
|
|
:
|
LAMP
|
| خلاصه یا چکیده
|
:
|
بيماري نواري باكتريايي از مهم¬ترين بيماري¬هاي بذرزاد غلات بخصوص گندم و جو می¬باشد. این بیماری با ایجاد لکه¬های قهوه¬ای تیره روي گلوم¬ها که به بیماری پوشینه سیاه نیز معروف است قادر به ایجاد 40 درصد خسارت در مزارع می¬باشد. علیرغم وجود بیماری نواری باکتریایی گندم در سال¬های اخیر در کشور، تاکنون روشی سریع و مقرون به صرفه از لحاظ اقتصادی در زمینه شناسایی دقیق عامل بیماری بر مبنای ویژگی‌های مولکولی در کشور انجام نگرفته است. از آنجایی که شناسایی درست عامل بیماری‌زا در توده¬های بذری گام مهمی در پیشنهاد راهکارهای موثر در مدیریت بیماری است، در این مطالعه توده¬های بذری آلوده به ویژه توده های بذری ارقام حساس به بیماری که در سطح وسیعی در کشور در حال کشت هستند از مناطق مختلف تحت کشت در کشور جمع‌آوری شد و با کیت تشخیصی مبتنی بر LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification) مورد بررسی مولکولی قرار گرفت. در این روش پرایمر ها بر اساس ژن های خانه داری rpod و dnak طراحی شدند، پرایمرهای طراحی شده بر اساس ژن rpod بیشترین کارایی را نشان دادند. برای بررسی کارکرد پرایمرها از دو توده بذری آلوده و کشت خالص باکتری، استخراج DNA انجام و طی واکنش LAMP مورد بررسی قرار گرفت.
به منظور تعیین حد تشخیص پرایمرهای طراحی شده از روش سریال رقت استفاده شد، پرایمرهای فوق تا تعداد 3.5×102 سلول باکتری در یک میلی لیتر را تشخیص دادند. تعیین اختصاصیت پرایمرهای فوق از طریق انجام واکنش LAMP روی جنس‌های مختلف باکتری‌های بیماریزای گندم اثبات گردید. نتایج این پروژه به منظور ردیابی و شناسایی سریع عامل بیماری لکه نواری باکتریایی در بذور گندم قابل استفاده بوده و می تواند به عنوان یکی از راهکارهای مدیریتی در تهیه بذور سالم مورد استفاده قرار گیرد.
|
|
|
:
|
Bacterial leaf streak (BLS) is one of the most important diseases of cereals, especially wheat and barley. This disease can cause yield losse up to 40% by causing dark brown spots on the glumes, called black chaff. Despite the existence of bacterial leaf streak on wheat in recent years in our country, so far, no fast and economically viable method to identify the causative agent of the disease based on molecular characteristics in the country has not been done. Since the correct identification of the pathogen in seed masses is an important step in proposing effective solutions in disease management, in this study, infected seed masses, especially disease-sensitive seed masses that are being cultivated on a large scale in the country from different regions collected in the country and molecularly examined with a diagnostic kit based on LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification). In this method, primers were designed based on housekeeping genes rpod and dnak, primers designed based on rpod gene showed the most efficiency. To check the function of primers, DNA extraction of seed masses and pure culture of bacteria were performed and analyzed during LAMP reaction.
In order to determine the detection limit of the designed primers, the serial dilution method was used; the above primers detected up to 3.5 x 102 bacteria cells per mililiter. The specificity of the above primers was proved by performing the LAMP reaction on different genera of wheat pathogenic bacteria. The results of this project can be used to track and quickly identify the cause of bacterial leaf streak disease in wheat seeds and can be used as one of the management strategies in preparing healthy seeds.
|