|
" شناسایی و تعیین هویت مولکولی دو سویه ویروس سندرم کاهش تولید تخم‌مرغ موجود در موسسه رازی "
| شماره شناسایی
|
:
|
18867876
|
| شماره مدرک
|
:
|
۶۰۰۲۲
|
| شناسه افزوده
|
:
|
بشاشتی، محسن
|
|
|
:
|
بنانی، منصور
|
|
|
:
|
حایریان اردکانی، بهرام
|
|
|
:
|
گودرزی، حسین
|
|
|
:
|
ملکوتی، آیدین
|
|
|
:
|
باباخانی، مهناز
|
|
|
:
|
آهنگران، سلیمه
|
|
|
:
|
حمزه، مهدی
|
|
|
:
|
بنانی، ستاره
|
|
|
:
|
موسویان، مهدی
|
| عنوان اصلي
|
:
|
شناسایی و تعیین هویت مولکولی دو سویه ویروس سندرم کاهش تولید تخم‌مرغ موجود در موسسه رازی
|
| عنوان اصلي به زبان ديگر
|
:
|
:Identification and characterization of two strains of egg drop syndrome virus available in the Razi institute
|
| صفحه شمار
|
:
|
۵۷ ص.:مصور، جدول، نمودار
|
| وضعیت انتشار
|
:
|
کرج: موسسه تحقيقات واكسن و سرم سازي رازي، ۱۳۹۹
|
| فروست
|
:
|
شماره ثبت ۶۰۰۲۲ مورخ ۱۴۰۰/۰۵/۱۹۶۰۰۲۲
|
|
|
:
|
شماره طرح ۹۷۰۳۲۳-۹۷۰۰۵-۰۱۷-۱۸-۱۸-۲
|
|
|
:
|
شماره نامه: سامانه سمپات
|
|
|
:
|
این طرح: مقدماتی است
|
| خلاصه یا چکیده
|
:
|
سندرم کاهش تولید تخم‌مرغ (EDS) در طیور به‌طور فراگیر شایع است. این بیماری توسط ویروس EDS (EDSV) ایجاد می‌شود که این ویروس عضوی از جنس آتادناویروس و خانواده آدنوویریده است. بیماری مرتبط با خسارات اقتصادی قابل توجه در صنعت طیور تجاری در سراسر دنیا بدلیل کاهش تولید تخم‌مرغ، کاهش کیفیت تخم‌مرغ و عدم رسیدن به پیک تولید می‌باشد. واکسن‌های غیرفعال با یاور روغنی به‌طور گسترده مورد استفاده قرار می‌گیرد و حفاظت خوبی را دربرابر EDS ایجاد می‌کند. اگرچه واکسیناسیون EDS توسط صنعت مرغداری کشور به‌طور گسترده استفاده می‌شود، اما واکسن این بیماری در ایران تولید نمی‌شود و از چندین شرکت بین‌المللی تولید واکسن وارد می‌شود. در این مطالعه، دو سویه EDSV (سویه الف و سویه ب) موجود در موسسه تحقیقات واکسن و سرم‌سازی رازی مورد آنالیز فیلوژنتیک و ژنتیک قرار گرفتند. استخراج DNA از مایع آلانتوئیک تخم‌مرغ جنین‌دار آلوده به سویه‌های الف و ب بااستفاده از کیت تجاری صورت گرفت. قسمت‌های دارای هم‌پوشانی توالی ژنوم ویروسی توسط PCR بااستفاده از 25 جفت پرایمر تکثیر گردید. پس از خالص‌سازی محصولات PCR، آن‌ها مورد توالی‌یابی کل ژنومی توسط شرکت سرویس‌دهنده خدمات توالی‌یابی تجاری بااستفاده از توالی‌یابی نسل بعدی قرار گرفتند. نتایج مطالعه حاضر نشان داد که هر دو سویه مورد مطالعه شباهت 100 درصدی در سطح نوکلئوتیدی با یکدیگر دارند. همولوژی نوکلئوتیدی مشاهده شده بین ژنوم‌های سویه‌های مورد مطالعه و سویه رفرانس اردک تخم‌گذار AV-127 (NC_001813) 9/99 درصد بود. ژنوم آن‌ها دارای طول 33214 نوکلئوتیدی با محتویات G+C 01/43 درصد بود. درمقایسه توالی ژنومی ویروس‌های مورد مطالعه با سویه AV-127، تنها 3 پلی‌مورفیسم نوکلئوتیدی تک (SNP) بین این توالی‌های ژنومی یافت شد. از این SNP ها، موتاسیون S320G در شفت پروتئین fiber مشاهده شد که ممکن است در آداپتاسیون EDSV در تخم‌مرغ جنین‌دار مرغ نقش بازی کند. اطلاعات توالی ژنومی سویه‌های EDS در تولید و توسعه واکسن‌های مولتی‌والان در آینده نزدیک کمک کننده است. کلیدواژه: سندرم کاهش تولید تخم‌مرغ (EDS)، ویروس EDS، آتادناویروس، توالی‌یابی نسل جدید (NGS)، تشخیص هویت مولکولی، آنالیز فیلوژنتیک
|
|
|
:
|
Egg drop syndrome (EDS) is prevalent in poultry globally. This disease is caused by EDS virus (EDSV), a member of the genus Atadenovirus under the family Adenoviridae. The disease is associated with significant economic losses to the poultry industry worldwide, due to drop in egg production, reduction in egg quality and failure to achieve peak egg production. Oil‐adjuvant inactivated vaccines are widely used and give good protection against EDS. Although, EDS vaccination has been adopted by Iranian poultry industry extensively, the vaccine is not produced locally and imported from several international vaccine companies. In this study, two EDSV strains (strains A and B) available in the Razi Vaccine and Serum Research Institute were subjected to phylogenetic and genetic analysis. Viral DNA was extracted from the allantoic fluid of embryonated chicken eggs infected with strains A and B using a commercial DNA isolation kit. Overlapping fragments of the viral genome sequence were generated by PCR using 25 pairs of primers. After purification of PCR products, they were sequenced at a commercial DNA service company by next generation sequencing. The results of current study indicated that both studied strains shared identities of 100% at the nucleotide level. The nucleotide homology obsereved between genomes of studied strains and that of laying duck original strain AV-127 (NC_001813), was 99.9%. Their genomes were 33,214 bp in length, with a G+C content of 43.01%. When comparing the genome sequences of studied viruses to strain AV-127, we found only 3 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) between these viral genome sequences. Of these SNPs, mutation S320G was observed in the shaft of fiber protein which may play a role in adaptation of EDSV in embryonated chicken eggs. The genome sequence information of the EDS strains will help to open up new vistas in developing new multivalent vaccines in near future.Keywords: Egg drop syndrome (EDS), EDS virus, Atadenovirus, next generation sequencing (NGS), molecular characterization, phylogenetic analysis
|
| |