|
" : تعیین مشخصات مولکولی ژن های M، N، 3`UTR ویروس برونشیت عفونی طیور سویه های H-120 و H-52 "
| شماره شناسایی
|
:
|
18867874
|
| شماره مدرک
|
:
|
۶۰۰۲۰
|
| شناسه افزوده
|
:
|
پیشرفت ثابت، لیلا
|
|
|
:
|
مسعودی، شهین
|
|
|
:
|
شاهسوندی، شهلا
|
|
|
:
|
سلیمی، ایوب
|
| عنوان اصلي
|
:
|
: تعیین مشخصات مولکولی ژن های M, N, 3`UTR ویروس برونشیت عفونی طیور سویه های H-120 و H-52
|
| عنوان اصلي به زبان ديگر
|
:
|
:Molecular determination of M, N and 3'UTR genes of infectious bronchitis virus H120 and H52 strains
|
| صفحه شمار
|
:
|
۶۰ ص.:مصور، جدول، نمودار، نقشه
|
| وضعیت انتشار
|
:
|
کرج: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، ۱۳۹۸
|
| فروست
|
:
|
شماره ثبت ۶۰۰۲۰ مورخ ۱۴۰۰/۰۵/۱۹۶۰۰۲۰
|
|
|
:
|
شماره طرح ۹۶۰۹۴۳-۰۸۷-۱۸-۱۸-۲
|
|
|
:
|
شماره نامه: سامانه سمپات
|
|
|
:
|
این طرح: بنیادی است
|
| خلاصه یا چکیده
|
:
|
برونشيت عفوني یک بیماری حاد و بسیار مسری در ماکیان می باشد که منجر به زیان های مالی فراوانی در صنعت طیور می شود. عامل اتیولوژی بیماری، ویروس IB است که ژنوم آن RNA تک رشته ای با سنس مثبت است. همانند بسیاری از RNAویروس¬ها، IBV به علت عدم وجود خاصیت تصحیح اشتباه مناسب، تغییرات ژنتیکی زیادی را نشان می دهد. چندین سروتیپ یا ژنوتیپ از IBV شناسایی شده است که حفاظت بخشی متقاطع محدودی مابین این سروتیپ ها وجود دارد. انواع واکسن¬های غیرفعال و زنده تخفیف حدت¬یافته حاوی سروتیپ¬های مختلف ویروس به طور وسیع برای کنترل بیماری مورد استفاده قرار می¬گیرد. واکسن¬های سویه ماساچوست (H120، Ma5 و H52) رایج¬ترین واکسن¬های IB هستند که در تمام کشورها استفاده می¬شوند. به علت تغییرپذیری بالای ناحیه S1 از پروتئین زائده، بررسی تغییرپذیری و تکامل ژن¬های IBV اغلب توسط آنالیز ناحیه S1 انجام می¬شود. اما شواهد نشان داده اند که تغییرپذیری در پروتئین¬های N وM و نیز ناحیه 3'UTR ژنوم ویروس نیز مشاهده می¬شود. در این مطالعه، توالی مولکولی ژن¬های M، N و ناحیه 3'UTR سویه¬های H52 و H120 ویروس IB موسسه رازی مورد بررسی قرارگرفت. برای این منظور، تکثیر ژن¬های M، N و 3'UTR ویروس IB سویه¬های H120, H52 موسسه رازی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و آزمایش RT-PCR انجام شد. محصول PCR در وکتور pTZ57R/T کلون شد. کلون¬های M، N و 3'UTR به صورت دو طرفه تعیین توالی شدند. توالی ژن¬ها در پایگاه داده GenBank ثبت شدند. همچنین هم-ردیفی این توالی¬ها با سایر توالی¬های مشابه سویه¬های واکسن ثبت شده در بانک ژنی با استفاده از نرم افزار MEGA 6 روش Clustal W انجام شد. درخت فیلوژنی توالی¬های هم¬ردیف شده توسط روش Neighbor-Joining ( با هزار بار تکرار) رسم شد. نتیجه نشان داد که این سه ژن از سویه¬های H120 و H52 موسسه رازی بیش از 99% همسانی با ژن¬های سایر ویروس¬های مشابه دارند. در درخت فیلوژنی این توالی ها در شاخه ویروس های مشابه قرار می¬گیرند. در این بررسی، توالی نوکلئوتیدی سه ژن 3UTR, N, M ویروس¬های برونشیت سویه های H52 , H120 موسسه رازی تعیین گردید و در مقایسه با سایر سویه های H120 و H52 ثبت شده در بانک ژنی، تغییرات بسیار محدودی در این ژ¬ها ملاحظه گردید. واژگان کلیدی: ویروس برونشیت عفونی، H120، H52، ژن¬های M، N و 3'UTR، توالی نوکلئوتیدی
|
|
|
:
|
Infectious bronchitis (IB) is an acute and highly contagious disease in poultry that leads to many financial losses in the poultry industry. The etiological agent of the disease is IB virus, whose genome is a single-stranded RNA of positive polarity. Like most other RNA viruses, IBV shows a huge genetic variation due to lack of a proper proofreading activity. Many serotypes or genotypes of IBV have been identified and limited cross-protection were found between different serotypes. Inactivated and live attenuated vaccines containing different serotypes of the virus are widely used to control the disease. The Massachusetts strain vaccines (H120, Ma5, and H52) are the most common IB vaccine that used in all countries. Due to the high variability of the S1 region of the spike protein, the genetic diversity and viral evolution of IBV are mostly monitored by analysis of the S1 gene. However, evidence revealed that there are significant variations in the N and M genes as well as 3'UTR region of the genome of the IB viruses. In this study, we determined the molecular sequence of M, N and 3'UTR genes of IB H120 and H52 RAZI viruses, in order to provide the molecular information of these genes.For this purpose, amplification of M, N and 3'UTR genes of IB H120, H52 strains virus of Razi Institute was performed using specific primers with RT-PCR test. The PCR products were cloned into pTZ57R/T vector. Clones of M, N and 3'UTR genes of H120 and H52 viruses were sequenced in both directions. Gene sequences were submitted in the GenBank database. Also, these sequences were aligned using MEGA 6 software by Clustal W method with previously published sequencing data of other IB vaccine viruses. A phylogenic tree of aligned sequences was constructed by Neighbor-Joining method (1000 replicate for bootstrap). The results showed that these three genes of the IBV H120 and H52 strains have more than 99% identity with the genes of other similar viruses. Phylogenic tree indicated that they fall into distinct branch of H120 and H52 viruses. In this study, nucleotide sequences of M, N and 3'UTR genes of IB H120, H52 strains virus of Razi Institute were determined and compared to other the same genes deposited in GenBank, very limited changes were observed. Keywords: IBV, H120 strain, M, N, 3'UTR, Nucleotide sequence
|
| |