بررسی رابطه فایلوژنی و ساختار جمعیتی 2 گونه (Holothuria parva، Holothuria arenicola) از خیار دریایی در خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از نشانگرهاي mtDNA،CO1

مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

منو

" بررسی رابطه فایلوژنی و ساختار جمعیتی 2 گونه (Holothuria parva، Holothuria arenicola) از خیار دریایی در خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از نشانگرهاي mtDNA،CO1 "

شماره شناسایی	:	18864672
شماره مدرک	:	۵۸۲۷۳
نام عام مواد	:	[گزارش نهایی -ویژه]
شناسه افزوده	:	پذیر، محمدخلیل
	:	رضوانی گيل‌کلایی، سهراب
	:	اژدهاکش‌پور، اشکان
	:	نیامیمندی، نصیر
	:	حسينی‌شبانکاره، مهرداد
	:	تمدنی‌جهرمی، سعید
	:	نظاری، محمدعلی
	:	انصاری، فرخ
	:	صفری، رقیه
	:	مسافر، مرجان
	:	زرشناس، غلامعباس
	:	ولی‌نسب پوری، تورج
عنوان اصلي	:	بررسی رابطه فایلوژنی و ساختار جمعیتی 2 گونه (Holothuria parva, Holothuria arenicola) از خیار دریایی در خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از نشانگرهاي mtDNA،CO1
عنوان اصلي به زبان ديگر	:	:Evaluation of phylogeny reconstruction and population structure of two species (Holothuria parva and H. arenicola) of sea cucumber in Persian Gulf and Oman Sea by mtDNA and CO1 marker
صفحه شمار	:	۷۹ ص.:مصور، عکس(رنگی)، جدول، نقشه
وضعیت انتشار	:	تهران: موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، پژوهشکده میگوی کشور، ۱۳۹۸
فروست	:	شماره ثبت ۵۸۲۷۳ مورخ ۱۳۹۹/۰۷/۰۲
	:	شماره طرح ک۹۴۰۱-۹۵۰۰۳-۹۵۵۱-۱۲-۱۲-۱۴۸
	:	شماره نامه: سامانه سمپات
	:	این طرح: بنیادی است
	:	۵۸۲۷۳
شماره ثبت	:	۴۳۷۴
خلاصه یا چکیده	:	در این تحقیق رابطه فایلوژنی و ساختار جمعیتی گونه‌های مختلف خیار دریایی در مناطق مختلف سه استان ساحلی بوشهر، هرمزگان و سیستان و بلوچستان از طریق روش توالی یابی ژن 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفت. پس از نمونه‌برداری از ایستگاه‌های بندر بوشهر، دیر، بستانه، لنگه، جزیره لارک، جزیره قشم و خلیج چابهار، استخراج DNA با استفاده از بافر Lysis انجام گرفت. پس از تکثیر ژن مربوطه با استفاده از دستگاه ترموسایکلر، محصول PCR بدست آمده توالی یابی گردید. نتایج حاصل از بر هم نهی‌های موضعی حاکی از شناسایی گونه Holothuria parva در سواحل بندر بوشهر، دیر و لنگه، H. arenicola در سواحل بندر بستانه و جزیره قشم، H. leucospilota در سواحل جزیره لارک و خلیج چابهار و در نهایت گونه‌های S.herrmanni، H. pardalis و H. scabra در خلیج چابهار بود. با توجه به اینکه در درخت‌های تبارزایشی ترسیم شده، فواصل ژنتیکی به دست آمده در گونه‌های H. parva و H. arenicola نمایانگر جمعیت‌های مجزا نبود، این احتمال وجود دارد که نمونه‌های مربوط به گونه‌های H. parva جمع آوری شده از بندر بوشهر، بندر دیر و بندر لنگه و گونه H. arenicola جمع آوری شده از بندر لنگه و جزیره قشم به دلیل جریان ژنی بالا و وجود هاپلوتایپ مشترک از یک جمعیت یکسان باشند. درحالیکه در رابطه با H. leucospilota به دلیل وجود هاپلوتیپ‌های مجزا و عدم وجود هاپلوتیپ مشترک نتایج دال بر وجود دو جمعیت متفاوت بود.کلمات کلیدی: خیار دریایی، خلیج فارس، دریای عمان، فایلوژنی، 16srRNA.
	:	In this study, the phylogeny reconstruction and population structure were investigated species of sea cucumber in different coastal provinces of Bushehr, Hormozgan and Sistan and Baluchestan by 16S rRNA. Samples were taken from Bushehr Port, Deir Port, Bastaneh Port, Lengeh Port, Lark Island, Qeshm Island and Chabahar Bay then DNA extracted by Lysis buffer. The 16S rRNA genome amplified by the thermo cycler after that the PCR product sequenced. The results of nucleotide blast identified of Holothuria parva in Bushehr, Dayyer and Lengeh coasts, H. arenicola in Bostaneh Port and Qeshm Island, H. leucospilota at Lark Island and Chabahar Bay and S.herrmanni, H. pardalis and H. scabra at Chabahar Bay. Base on genetic index, H. parva (Bushehr, Dayyer and Lengeh) and H. arenicola (Bostaneh and Qeshm) because of the high gene flow and common haplotype were not Separate population. Whereas H. leucospilota were different population due to there are distinct haplotypes and lack of common haplotypes.Key word: Sea cucumber, Persian Gulf, Oman Sea, phylogeny, 16s rRNA