| شماره شناسایی
|
:
|
18859396
|
| شماره مدرک
|
:
|
۵۶۶۹۶
|
| نام عام مواد
|
:
|
[گزارش نهایی -ویژه]
|
| شناسه افزوده
|
:
|
ثعلبی، فاطمه
|
|
|
:
|
صالحی نجف‌آبادی، زهرا
|
|
|
:
|
جعفری، هدیه
|
|
|
:
|
نویدپور، شاهرخ
|
|
|
:
|
نظری‌شیروان، علی
|
|
|
:
|
صدر، آیه
|
|
|
:
|
فروزان، علیرضا
|
|
|
:
|
نعمتی، محمد
|
| عنوان اصلي
|
:
|
تکثیر و شناسایی برخی ژن‌هاي کد کننده پپتیدهای غده سمی عقربAndroctonus crassicauda استان خوزستان با استفاده از تکنیک توالی‌یابی تصادفی کتابخانه cDNA
|
| عنوان اصلي به زبان ديگر
|
:
|
:Amplification and identification of some genes encoding Khuzestan province scorpion Androctonus crassicauda venomous gland peptides using random sequencing of the cDNA library method.
|
| صفحه شمار
|
:
|
۵۳ ص.:مصور، عکس(رنگی)، جدول، نمودار
|
| وضعیت انتشار
|
:
|
کرج: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی شعبه جنوب غرب - اهواز، ۱۳۹۸
|
| فروست
|
:
|
شماره ثبت ۵۶۶۹۶ مورخ ۱۳۹۸/۰۱۰/۰۲
|
|
|
:
|
شماره طرح ۹۶۰۳۵۴-۰۲۰-۱۸-۸۳-۲
|
|
|
:
|
شماره نامه: سامانه سمپات
|
|
|
:
|
این طرح: بنیادی است
|
|
|
:
|
دستاورد بر حسب ماهیت: یافته‌های تحقیقاتی اثر بخش است
|
|
|
:
|
انتشار در قالب: مقالات علمی- پژوهشی داخلی و خارجی
|
|
|
:
|
۵۶۶۹۶
|
| خلاصه یا چکیده
|
:
|
در این مطالعه با استفاده از داده‌های حاصل از تکنیک توالی‌یابی رونوشت‌ها، اطلاعات بیولوژیکی کاربردی با پیشبینی عکس العمل و روابط ژنی استخراج شد. پیشرفت‌هاي سریع بوجود آمده در نسل دوم توالی‌یابی، توالی‌یابی RNA (RNASeq) ابزار قدرتمندتر و ارزانتري در مطالعات ترانسکریپتوم شده است. گردآوري مجدد توالی‌هاي ترانسکریپتوم، راه حل مناسبی براي مطالعه ترانسکریپتوم موجوداتی است که توالی ژنوم آنها در دسترس نیست. توالی‌یابی دقیق و مونتاژ قابل اعتماد در داده‌هاي ترانسکریپتوم، براي آنالیزهاي پایین دست ضروري می‌باشد. در این مطالعه با جداسازي و تعیین توالی ترانسکریپتوم غده زهر عقرب Androctonus crassicauda با استفاده از نسل دوم توالی‌یابی، نتایج ساخت ترانسکریپتوم و تجزیه و تحلیل داده ها بوسیله نرم افزارهای مختلف ارائه گردید. نتایج نشان داد که در مجموع 952725 کانتیگ ساخته شد که از این تعداد 585177 یونی‌ژن به دست آمد. نتایج بلاست پروتئنی شناسایی 22270 ژن دارای تفسیر در پایگاه اطلاعاتی و تعداد 562908 یونی‌ژن مربوط به ژن‌های جدید و توالی‌های غیر کد کننده پروتئین بود. علاوه بر آن، شناسایی 2058 ژن ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی مربوط به گونه‌های مختلف عقرب و همچنین شناسایی 448 ژن ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی مربوط به سایر گونه‌های تولید کننده توکسین، از دستاوردهای دیگر این مطالعه بود. نتایج آنالیز بیان در سطح ژن و سایر ویژگی‌های ژنی نشان داد که از مجموع ژن‌های بیان شده در بین دو جنس 132 ژن دارای تفاوت بیان معنی‌داری بودند. سطح معنی داری در تعیین بیان متفاوت در بین دو جنس 5 درصد در نظر گرفته شد. از این تعداد 91 ژن در نر نسبت به ماده افزایش بیان و 41 ژن کاهش بیان نشان دادند. کلمات کلیدی: RNASeq، تفاوت بیان، ترانسکریپتوم، Androctonus crassicauda
|
|
|
:
|
In this study, using data derived from transcription sequencing technique, biological functional in-formation was extracted with prediction of reaction and genetic relationships. With the rapid advances in next generation sequencing technology, RNA sequencing has risen as a cost-effective and powerful method for transcriptome study. De novo assembly of transcripts provides main solution to transcrip-tome analysis for organisms without reference genome. Precise sequencing and assembly of transcrip-tome reliable data are necessary for the downstream analysis. Accordingly, in this work, the isolation and sequencing of Androctonus crassicauda scorpion venom transcriptome was performed using next-generation sequencing, the results of transcriptome assembly and data analysis by various soft-ware, presented. The results showed that a total of 952725 cantig was created, that including those contig, 585177 unigene were obtained. Protein blast results detected 22270 genes with a commentary in the database and 562908 unigens related to new genes and non-coding sequences of proteins. In addition, the identification of 2058 genes recorded in the database for various species of scorpion, as well as the identification of 448 genes recorded in the database for other producing toxin species, was another achievement of this study. The results of expression analysis at the gene level and other genet-ic features showed that of the sum of genes expressed in two sexes, there were significant differences in 132 genes. The significance level was 5% in determining the difference between sexes. Of these, 91 male genes showed increased expression and 41 genes showed decreased expression in relation to fe-male.Key Word: RNASeq, Differential expression, Transcriptom, Androctonus crassicauda
|